Toplantı Rezervasyonu

Genom Sekanslama

Genom Sekanslama

  • Whole Genome Sequencin(WGS)

Genom Sekanslama

Tüm genom sekanslama, bir organizmanın DNA’sının tamamını yüksek hassasiyetle analiz etmeyi mümkün kılan ileri düzey bir moleküler tekniktir. LetgenPro’nun sunduğu WGS hizmeti, geniş kapsamlı varyasyon tespiti, genom karşılaştırmaları ve evrimsel analizler gibi birçok araştırma amacına uygun veri sağlar.

İster insan, ister bitki, hayvan ya da mikrobiyal örnekler olsun, her tür için optimize edilmiş analiz protokolleriyle yüksek kapsama derinliği, düşük hata oranı ve anlamlı biyoinformatik çıktı sunarız.

LetgenPro ile çalıştığınızda ham veriyle baş başa kalmazsınız. Projenizin kapsamına göre belirlediğimiz özelleştirilmiş analiz derinliği, bioinformatik filtreleme algoritmaları ve rapor formatları, deneylerinizi doğrudan sonuç odaklı hale getirir.

İnsan WGS

İnsan WGS, bireylerin genomunu baştan sona analiz ederek varyant profili, nadir mutasyonlar ve genomik yapı hakkında detaylı bilgi sağlar. LetgenPro’nun sunduğu bu hizmet, yüksek kapsama (≥30X), %99,9 doğruluk ve en son referans genomlara hizalama gibi avantajlarla araştırmalarınıza güvenli bir zemin kazandırır.

Genetik varyasyonların tespiti, polimorfizm analizi (SNP/Indel), mutasyon hotspot bölgeleri ve genom genelinde heterozigotluk gibi analizler standart hizmet paketimizde yer alır. Daha fazlasına ihtiyacınız varsa, talep etmeniz halinde size özel paket oluşturabiliriz.

Hayvan/Bitki WGS

Bitki ve hayvan genomlarının sekanslanması; verimlilik, dayanıklılık, stres toleransı ve hastalıklara direnç gibi önemli özelliklerin genetik temellerini ortaya çıkarmaya yardımcı olur. Islah programlarının moleküler düzeyde yönlendirilmesini sağlar.

LetgenPro, bitki ve hayvan türlerine özel optimize edilmiş WGS protokolleri ile araştırmacılara genetik çeşitlilik analizi, tür karşılaştırması ve genomik kaynak geliştirme gibi projelerde güvenilir veri akışı sunar. Ayrıca LetgenPro, farklı türlerin genomik özelliklerine özel dizileme çözümleri sunar:

  • Büyük genomlar için optimize edilmiş veri derinliği,
  • Poliploid türlerde doğru hizalama stratejileri,
  • Genom boyutuna uygun okuma uzunlukları ve coverage oranları.

Genetik marker keşfi, tür karşılaştırması, evrimsel analiz ve fenotip-genotip ilişkilerini aydınlatmaya yönelik projelerde yüksek kaliteli veri sağlarız.

Mikrobiyal WGS

Bakteri, maya ve diğer mikroorganizmaların tüm genomlarının sekanslanması; tür doğrulama, direnç genlerinin taranması, mobil genetik elementlerin analizi ve filogenetik incelemeler için oldukça değerlidir. Küçük ama kritik genetik farklar mikrobiyal davranışları değiştirebilir.

LetgenPro, yüksek kapsama derinliğine sahip mikrobiyal WGS hizmetleriyle, gıda, çevre ve sağlık alanlarındaki araştırmalarda kesin ve tekrarlanabilir veriler sağlar. Suş bazlı analiz ihtiyaçlarında kaliteyi önceliklendirir.

Plasmid Sequencing

Plazmidler, moleküler biyolojide gen taşıma, ekspresyon ve düzenleme işlemlerinde kritik rol oynayan genetik araçlardır. Bu nedenle, kullanılan plazmidin yapısının eksiksiz ve doğru şekilde belirlenmesi deneysel güvenilirlik açısından zorunludur. LetgenPro, plazmid sekanslamada Oxford Nanopore Technology (ONT) tabanlı uzun okuma dizileme yöntemlerini kullanarak, dairesel DNA moleküllerinin tamamını tek seferde okuyabilen güçlü bir çözüm sunar.

Kısa okuma temelli sistemlerde, plazmidin lineerleştirilmiş küçük parçaları okunur ve yazılım yoluyla birleştirilerek tam yapı tahmin edilmeye çalışılır. Bu süreç, özellikle tekrarlayan bölgelerde, GC-rich sekanslarda veya büyük insersiyonlarda hata riski doğurur. Ayrıca okuma yönü, yerleşim sırası ve yapısal bütünlük hakkında netlik sağlamaz.

Buna karşılık ONT tabanlı uzun okuma teknolojisi, plazmidin tamamını tek bir molekül olarak okuyabilir. Bu sayede, dairesel yapı korunarak başlangıç-bitiş noktası belirsizliği, yer değiştirme hataları ve montaj kaynaklı boşluklar ortadan kalkar. Tüm vektör mimarisi—promotörler, seçici marker’lar, MCS bölgeleri ve insert diziler—bir bütün halinde görselleştirilebilir

LetgenPro, bu hizmet kapsamında araştırmacılara yüksek doğrulukta ve yüksek kapsama sahip ham veri (raw data) sunar. Kullanıcılar, kendi analiz akışlarını esnek biçimde oluşturabilir ve projeye özel veri işleme stratejileri geliştirebilir.