Transkriptom Sekanslama
- Anasayfa
- Transkriptom Sekanslama
Transkriptom Sekanslama
Transkriptom Sekanslama
Bir hücrenin genetik potansiyeli sabittir; ancak o potansiyelin ne kadarının, ne zaman ve nasıl kullanıldığı, yani gen ifadesi, çevresel koşullara, gelişim evresine, hücre tipine ve daha pek çok etkene bağlı olarak sürekli değişir. Transkriptom sekanslama, bu dinamik sürecin kapsamlı bir haritasını çıkarır.
Araştırma amacına göre farklı yaklaşımlar tercih edilir: yalnızca kodlanan bölgeleri görmek istiyorsanız mRNA sekanslama yeterli olabilir; ancak kodlanmayan RNA’ların da sürece dahil olduğunu düşünüyorsanız total RNA sekanslama daha uygundur. Regülasyon mekanizmalarına odaklanıyorsanız, small RNA sekanslama kaçınılmaz hale gelir. LetgenPro, bu karar sürecinde yalnızca hizmet sunan değil, teknik bir yol arkadaşı olarak çalışır.
Her bir analiz tipi, sadece veriyi değil, o verinin biyolojik bağlamını anlamayı gerektirir. Bu nedenle sekanslama kadar, ardından gelen analiz süreci de en az onun kadar önemlidir.
İster kanser biyolojisi, ister stres yanıtı, ister gelişimsel süreçler üzerine çalışın; doğru transkriptom stratejisi sizi doğrudan sonuca götürür. Biz sadece veri üretmiyoruz, yön de gösteriyoruz. Transkriptom düzeyinde hücrenin iç sesini duymak isteyen herkesi LetgenPro’ya bekliyoruz.
mRNA Sekanslama
mRNA sekanslama, hücrede o anda aktif olan, yani ifade edilen genleri görmemizi sağlar. Bu yaklaşım, özellikle farklı koşullarda ya da zaman dilimlerinde hücrelerin nasıl davrandığını karşılaştırmak için kullanılır.
Farklılaşma, ilaç yanıtı, stres koşulları ya da hastalık durumlarını moleküler düzeyde anlamak isteyen araştırmalar için temel analiz yöntemlerinden biridir. Ancak ham veri üretimi tek başına anlamlı değildir. Analiz sürecinde gen ifadelerinin normalize edilmesi, gruplar arası farkların istatistiksel olarak değerlendirilmesi, gen seti bazlı yorumların yapılabilmesi gerekir.
LetgenPro, bu süreci veri üretimiyle sınırlamaz. Projenizin kapsamına göre uygun okuma derinliği, örnek sayısı, istatistiksel yaklaşım ve anlamlı biyolojik yorum seçenekleriyle ilerler.LetgenPro, bu noktada devreye giriyor. Kapsamlı biyoinformatik analizlerimizle size sadece “ham veri” değil, anlamlı sonuçlar sunuyoruz: diferansiyel ifade analizi, gen zenginleştirme (GO/KEGG), örnek kümelenmesi, PCA, ısı haritaları ve daha fazlası.
Bu hizmet, özellikle ilaç hedefi keşfi, biyobelirteç taramaları, kanser alt tip ayrımı ve gelişimsel biyoloji projeleri için vazgeçilmezdir. Hangi genlerin konuştuğunu bilmek istiyorsanız, LetgenPro yanınızda.
Tüm Transcriptom Sekanslama
(Total RNA Sekanslama)
Genomun sadece küçük bir kısmı protein kodlar; geri kalan büyük sessiz bölge aslında oldukça aktiftir. Total RNA sekanslama, bu sessiz gibi görünen alanların ifade profilini de açığa çıkarır. LetgenPro’nun sunduğu bu hizmet, rRNA dışlama ile hem mRNA’yı hem de lncRNA, snoRNA, snRNA gibi kodlamayan RNA türlerini aynı anda analiz etmenize olanak tanır.
Üstelik yalnızca veri üretmekle kalmıyor, biyoinformatik analiz paketi ile size derinlemesine veri sunuyoruz: diferansiyel ifade, klasterleme, heatmap ve PCA görselleştirme, fonksiyonel anotasyon, novel transcript keşfi ve daha fazlası projeye özel hazırlanıyor.
LetgenPro burada da fark yaratıyor. Sadece tüm RNA’ları dizilemiyor, sizin için hangisinin önemli olduğunu analiz ediyoruz. Karmaşık veri setlerini anlamlandırmak bizim işimiz. Projenize özel veri derinliği, analiz filtresi ve görselleştirme stratejileriyle anlamlı sonuçları netleştiriyoruz. Genomun görünmeyen tarafına ulaşmak istiyorsanız, sizin için hazırız.
Small-RNA Sekanslama
Hücredeki en ince ayarlardan biri, küçük RNA’larla yapılır. miRNA, siRNA, piRNA gibi moleküller, gen ifadesinin post-transkripsiyonel düzenleyicileri olarak görev yapar. LetgenPro, bu küçük ama etkili RNA’ların dizilenmesinde yüksek hassasiyetli small RNA-seq hizmeti sunar.
Ama bu moleküller küçük diye önemsiz sanmayın. Onları yakalamak zordur. Düşük bollukta olurlar, genellikle kısa ve benzer sekanslara sahiptirler. İşte bu yüzden özel kütüphane hazırlığı, yüksek hassasiyetli dizileme protokolü ve çok dikkatli biyoinformatik filtreleme gerekir.
LetgenPro olarak kapsamlı small RNA sekanslama hizmetimizi sunuyoruz. 15–40 nt aralığındaki RNA’lar için optimize edilmiş kütüphane hazırlığı ve özel sekanslama protokollerine ek olarak, biyoinformatik analiz paketiyle gelen veri, doğrudan bilimsel sonuca dönüşür. Size sunduğumuz yalnızca miRNA listesi değil; hedef gen tahminleri, regülasyon ağları, ifade analizi ve fonksiyonel zenginleştirme analizleriyle, bu küçük moleküllerin biyolojik bağlamı gibi çok kapsamlı analizler de sunuyoruz.
Bu hizmet özellikle kanser araştırmaları, immünoloji, gelişim biyolojisi ve biyobelirteç keşfi için çok değerlidir. Küçük RNA’ların büyük etkisini keşfetmek istiyorsanız, LetgenPro ile tanışın.